22 июня 1941 года в городском саду троичане узнали о начале Великой Отечественной войны, здесь прошёл многотысячный митинг, был организован штаб.
В здании Троицкого ветеринарного института в период с 01.09.41 г. по 24.09.43 г. размещался эвакогоспиталь № 3755 для бойцов раненных на фронтах Великой Отечественной войны.
В здании Троицкого педагогического училища в период с 17.07.41 г. по 30.09.44 г. размещался эвакогоспиталь № 1731 для бойцов раненных на фронтах Великой Отечественной войны.
В 1941 году из Москвы в Троицк был эвакуирован 34-ый военный завод. В ноябре более двух тысяч москвичей, в числе которых были рабочие, инженерно-технические работники и их семьи приехали в уральский город.